环肽与手性药物分子形成的包合物的理论研究(原稿)
上传者:佚名(113961154)| 上传时间:2020-08-02 17:23:20

1、合物的理论研究(原稿两个不同的客体分子来说,通过对不同角度不同距离扫描得到了两种不同的势能面。势能面如下图所示图进入CDP过程中扫描得到的势能面图进入CDP过程中扫描得到的势能面从图中可以看出,SPP和RPP对映体进入CDP的过程都是能量降低的趋势,这对于小分子进入主体大环是有利的因素。另外我们还从图中可以看出,在势能面上能量的最低点大约都在Z粤园附近,也就是说主客体结合的能量较低的结构大约都是在大环的中心,对于这些segawaJ,IshidaM,NakajimaT,HondaY,KitaoO,NakaiH,KleneM,LiX,KnoxJE,HratchianHP,CrossJB,BakkenV,AdamoC,JaramilloJ,GomertsR,StratmannRE,YazyevO,AustinAJ,CammiR,PomelliC,OchterskiJW,AyalaPY,MorokumaK,VotharamilloJ,GomertsR,StratmannRE,YazyevO,AustinAJ,CammiR,PomelliC,OchterskiJW,AyalaPY,MorokumaK,VothGA,SalvadorP,DannenbergJJ,ZakrzewskiVG,DarichS,DanielsAD,StrainMC,FarkasO,MalickDK,RabuckAD,Ragha。

2、an,Inc,WallingfordCT。手性识别是化学领域中最富有吸引力的现象之。它在分析化学有机化学和生物化学方面尤其重要,因此,寻找有效的主体分子直是化学家研究的方向。近年来,环肽已经被合成出来做主体分子与些生物活性物质组成包合物,用在抗癌药抗菌药和酶抑制剂。尽管实验上已广泛的用环肽做主体分子对手性药物分子进行了拆分,但是人们还是很少从原子水平上去研究它的原理。因此对环肽和手性药环肽与手性药物分子形成的包合物的理论研究(原稿)doc两个不同的客体分子来说,通过对不同角度不同距离扫描得到了两种不同的势能面。势能面如下图所示图进入CDP过程中扫描得到的势能面图进入CDP过程中扫描得到的势能面从图中可以看出,SPP和RPP对映体进入CDP的过程都是能量降低的趋势,这对于小分子进入主体大环是有利的因素。另外我们还从图中可以看出,在势能面上能量的最低点大约都在Z粤园附近,也就是说主客体结合的能量较低的结构大约都是在大环的中心,对于这些annRE,YazyevO,AustinAJ,CammiR,PomelliC,OchterskiJW,AyalaPY,MorokumaK,VothGA,SalvadorP,DannenbergJJ,ZakrzewskiVG,DarichS,DanielsAD,StrainMC,FarkasO,MalickDK,RabuckAD,RaghavachariK,Fore。

3、说,通过对不同角度不同距离扫描得到了两种不同的势能面。势能面如下图所示图进入CDP过程中扫描得到的势能面图进入CDP过程中扫描得到的势能面从图中可以看出,SPP和RPP对映体进入CDP的过程都是能量降低的趋势,这对于小分子进入主体大环是有利的因素。另外我们还从图中可以看出,在势能面上能量的最低点大约都在Z粤园附近,也就是说主客体结合的能量较低的结构大约都是在大环的中心,对于这些,GonzalezC,PoleJAGaussianGaussian,Inc,WallingfordCT环肽与手性药物分子形成的包合物的理论研究(原稿)。图a环十肽的构型和b利胆醇的构型结果和讨论寻求能量最低点。对于两个不同的客体分子来说,通过对不同角度不同距离扫描得到了两种不同的势能面。势能面如下图所示图进入CDP过程中扫描得到的势能面图进入CDP过程中扫描得到的势能面从图中可以看出,SPP和R环肽与手性药物分子形成的包合物的理论研究(原稿)docaromiI,MartinRL,FoxDJ,KeithT,AlLahamMA,PengCY,NanayakkaraA,ChallacombeM,GillPMW,JohnsonB,ChenW,WongMW,GonzalezC,PoleJAGaussianGaussian,Inc,WallingfordCT环肽与手性药物分子形成的包合物的理论研究(原稿)环肽与手性药物分子形成的。

4、包合物的构型特点。用BLYPGd,方法优化后的包合物的稳定结构如图所示图aBLYPGd,方法优化后得到的CDPSPP的最稳定的结构bCDPRPP的最稳定结构图a是CDPSPP的最稳定的结构,从图中我们可以清晰的看出,SPP的苯环几乎都插入在CDP的环内,因此SPP的羟基基团就刚好位于环十肽的边缘,这样更有利于SPP与CDP环边缘的氨基和羧基形成氢键,增加包合物的稳定性。图b是CDPRPP的最稳ollesalvetticorrelationenergyformulaintoafunctionaloftheelectrondensityJPhysRevB,FrischMJ,TrucksGW,SchlegelHB,ScuseriaGE,RobbMA,CheesemanJR,MontgomeryJA,VrevenJT,KudinKN,BurantJC,MillamJM,IyengarSS,To因此SPP的羟基基团就刚好位于环十肽的边缘,这样更有利于SPP与CDP环边缘的氨基和羧基形成氢键,增加包合物的稳定性。图b是CDPRPP的最稳定结构,从图中我们可以看出,RPP的苯环从大环中穿透过去,从而使得RPP的苯环只有部分在CDP的环内,它的OH基团直接朝向CDP的环内,这样不利于形成氢键,也不利于包合物的稳定性。参考文献,LiuR,TheoreticalstudiesofmonomeranGaussi。

5、YanC,LiX,XiuZ,hquercetinJJMolStruct,Theochem,BeckeAD,JJChemPhys,LeeC,YangW,ParrRG,DevelomentofthecollesalvetticorrelationenergyformulaintoafunctionaloftheelectrondensityJPhysRevB,FrischMJ,TrucksGW,uiQ,BaboulAG,CliffordS,CioslowskiJ,StefanovBB,LiuG,LiashenkoA,PiskorzP,KomaromiI,MartinRL,FoxDJ,KeithT,AlLahamMA,PengCY,NanayakkaraA,ChallacombeM,GillPMW,JohnsonB,ChenW,WongMW,GonzalezC,PoleJAGaussiasiM,ScalmaniG,RegaN,PeterssonGA,NakatsujiH,HadaM,EharaM,ToyotaK,FukudaR,HasegawaJ,IshidaM,NakajimaT,HondaY,KitaoO,NakaiH,KleneM,LiX,KnoxJE,HratchianHP,CrossJB,BakkenV,AdamoC,JaramilloJ,GomertsR,Strat两个不同的客体分子。

6、vachlegelHB,ScuseriaGE,RobbMA,CheesemanJR,MontgomeryJA,VrevenJT,KudinKN,BurantJC,MillamJM,IyengarSS,TomasiJ,BaroneV,MennucciB,CossiM,ScalmaniG,RegaN,PeterssonGA,NakatsujiH,HadaM,EharaM,ToyotaK,FukudaR,HsiM,ScalmaniG,RegaN,PeterssonGA,NakatsujiH,HadaM,EharaM,ToyotaK,FukudaR,HasegawaJ,IshidaM,NakajimaT,HondaY,KitaoO,NakaiH,KleneM,LiX,KnoxJE,HratchianHP,CrossJB,BakkenV,AdamoC,JaramilloJ,GomertsR,Strat能面上的能量最低点的结构,我们先用BLYPG方法进行了优化,然后再对图中得到的能量最低点用Gd,基组优化得到最稳定结构。参考文献,LiuR,TheoreticalstudiesofmonomeranddimerofcycloPheDAlanandcyclolPheDMeNAlannJJPhysChemB,OkamotoH,NakanishiT,NagaiY,dnanotubesJJAmChemSPP对映。

7、manJB,OrtizJV,PP对映体进入CDP的过程都是能量降低的趋势,这对于小分子进入主体大环是有利的因素。另外我们还从图中可以看出,在势能面上能量的最低点大约都在Z粤园附近,也就是说主客体结合的能量较低的结构大约都是在大环的中心,对于这些势能面上的能量最低点的结构,我们先用BLYPG方法进行了优化,然后再对图中得到的能量最低点用Gd,基组优化得到最稳定结构。图a环十肽的构型和b利胆醇的构型结果和讨论寻求能量最低点。对rgyformulaintoafunctionaloftheelectrondensityJPhysRevB,FrischMJ,TrucksGW,SchlegelHB,ScuseriaGE,RobbMA,CheesemanJR,MontgomeryJA,VrevenJT,KudinKN,BurantJC,MillamJM,IyengarSS,TomasiJ,BaroneV,MennucciB,Co剂。尽管实验上已广泛的用环肽做主体分子对手性药物分子进行了拆分,但是人们还是很少从原子水平上去研究它的原理。因此对环肽和手性药物分子的研究将会更好的理解主客体的包合作用,并阐明在生物受体中的手性识别过程。本论文采用密度泛函理论研究了环十肽和手性药物分子利胆醇的包合过程。参考文献,LiuR,TheoreticalstudiesofmonomeranddimerofcycloPheD。

8、论寻求能量最低点。对dimerofcycloPheDAlanandcyclolPheDMeNAlannJJPhysChemB,OkamotoH,NakanishiT,NagaiY,dnanotubesJJAmChemSoc,YanC,LiX,XiuZ,hquercetinJJMolStruct,Theochem,BeckeAD,JJChemPhys,LeeC,YangW,ParrRG,Develomentofthe物分子的研究将会更好的理解主客体的包合作用,并阐明在生物受体中的手性识别过程。本论文采用密度泛函理论研究了环十肽和手性药物分子利胆醇的包合过程。包合物的构型特点。用BLYPGd,方法优化后的包合物的稳定结构如图所示图aBLYPGd,方法优化后得到的CDPSPP的最稳定的结构bCDPRPP的最稳定结构图a是CDPSPP的最稳定的结构,从图中我们可以清晰的看出,SPP的苯环几乎都插入在CDP的环内uiQ,BaboulAG,CliffordS,CioslowskiJ,StefanovBB,LiuG,LiashenkoA,PiskorzP,KomaromiI,MartinRL,FoxDJ,KeithT,AlLahamMA,PengCY,NanayakkaraA,ChallacombeM,GillPMW,JohnsonB,ChenW,WongMW,GonzalezC,PoleJAGauss。

9、lanandcysiM,ScalmaniG,RegaN,PeterssonGA,NakatsujiH,HadaM,EharaM,ToyotaK,FukudaR,HasegawaJ,IshidaM,NakajimaT,HondaY,KitaoO,NakaiH,KleneM,LiX,KnoxJE,HratchianHP,CrossJB,BakkenV,AdamoC,JaramilloJ,GomertsR,Strat包合物的构型特点。用BLYPGd,方法优化后的包合物的稳定结构如图所示图aBLYPGd,方法优化后得到的CDPSPP的最稳定的结构bCDPRPP的最稳定结构图a是CDPSPP的最稳定的结构,从图中我们可以清晰的看出,SPP的苯环几乎都插入在CDP的环内,因此SPP的羟基基团就刚好位于环十肽的边缘,这样更有利于SPP与CDP环边缘的氨基和羧基形成氢键,增加包合物的稳定性。图b是CDPRPP的最稳A,SalvadorP,DannenbergJJ,ZakrzewskiVG,DarichS,DanielsAD,StrainMC,FarkasO,MalickDK,RabuckAD,RaghavachariK,ForesmanJB,OrtizJV,CuiQ,BaboulAG,CliffordS,CioslowskiJ,StefanovBB,LiuG,LiashenkoA,PiskorzP,Koc。

10、的包合物的理论研究(原稿)doc两个不同的客体分子来说,通过对不同角度不同距离扫描得到了两种不同的势能面。势能面如下图所示图进入CDP过程中扫描得到的势能面图进入CDP过程中扫描得到的势能面从图中可以看出,SPP和RPP对映体进入CDP的过程都是能量降低的趋势,这对于小分子进入主体大环是有利的因素。另外我们还从图中可以看出,在势能面上能量的最低点大约都在Z粤园附近,也就是说主客体结合的能量较低的结构大约都是在大环的中心,对于这些asiJ,BaroneV,MennucciB,CossiM,ScalmaniG,RegaN,PeterssonGA,NakatsujiH,HadaM,EharaM,ToyotaK,FukudaR,HasegawaJ,IshidaM,NakajimaT,HondaY,KitaoO,NakaiH,KleneM,LiX,KnoxJE,HratchianHP,CrossJB,BakkenV,AdamoC,PP对映体进入CDP的过程都是能量降低的趋势,这对于小分子进入主体大环是有利的因素。另外我们还从图中可以看出,在势能面上能量的最低点大约都在Z粤园附近,也就是说主客体结合的能量较低的结构大约都是在大环的中心,对于这些势能面上的能量最低点的结构,我们先用BLYPG方法进行了优化,然后再对图中得到的能量最低点用Gd,基组优化得到最稳定结构。图a环十肽的构型和b利胆醇的构型结果和。

11、asiM,ScalmaniG,RegaN,PeterssonGA,NakatsujiH,HadaM,EharaM,ToyotaK,FukudaR,HasegawaJ,IshidaM,NakajimaT,HondaY,KitaoO,NakaiH,KleneM,LiX,KnoxJE,HratchianHP,CrossJB,BakkenV,AdamoC,JaramilloJ,GomertsR,StratlolPheDMeNAlannJJPhysChemB,OkamotoH,NakanishiT,NagaiY,dnanotubesJJAmChemSoc,YanC,LiX,XiuZ,hquercetinJJMolStruct,Theochem,BeckeAD,JJChemPhys,LeeC,YangW,ParrRG,Develomentofthecollesalvetticorrelationen因此SPP的羟基基团就刚好位于环十肽的边缘,这样更有利于SPP与CDP环边缘的氨基和羧基形成氢键,增加包合物的稳定性。图b是CDPRPP的最稳定结构,从图中我们可以看出,RPP的苯环从大环中穿透过去,从而使得RPP的苯环只有部分在CDP的环内,它的OH基团直接朝向CDP的环内,这样不利于形成氢键,也不利于包合物的稳定性。参考文献,LiuR,Theoreticalstudiesofmonomeran稳定结构, 。

12、进入CDP的过程都是能量降低的趋势,这对于小分子进入主体大环是有利的因素。另外我们还从图中可以看出,在势能面上能量的最低点大约都在Z粤园附近,也就是说主客体结合的能量较低的结构大约都是在大环的中心,对于这些势能面上的能量最低点的结构,我们先用BLYPG方法进行了优化,然后再对图中得到的能量最低点用Gd,基组优化得到最稳定结构。图a环十肽的构型和b利胆醇的构型结果和讨论寻求能量最低点。对稳定结构,从图中我们可以看出,RPP的苯环从大环中穿透过去,从而使得RPP的苯环只有部分在CDP的环内,它的OH基团直接朝向CDP的环内,这样不利于形成氢键,也不利于包合物的稳定性。手性识别是化学领域中最富有吸引力的现象之。它在分析化学有机化学和生物化学方面尤其重要,因此,寻找有效的主体分子直是化学家研究的方向。近年来,环肽已经被合成出来做主体分子与些生物活性物质组成包合物,用在抗癌药抗菌药和酶抑hariK,ForesmanJB,OrtizJV,CuiQ,BaboulAG,CliffordS,CioslowskiJ,StefanovBB,LiuG,LiashenkoA,PiskorzP,KomaromiI,MartinRL,FoxDJ,KeithT,AlLahamMA,PengCY,NanayakkaraA,ChallacombeM,GillPMW,JohnsonB,ChenW,WongM环肽与手性药物分子形。